Обычное определение Мэри-Сью (Марти-Стью) - персонаж, а) похожий на автора, б) обладающий сверхмощными (по меркам мира) способностями, в) всеми прочими героями (кроме врагов) нежно обожаемый. А так ли все сие страшно?
Начнем с первого - схожесть с автором. Одно пособие по определению Мэрьки так напрямую и советовало ее выискивать: Персонаж назван/названа в Вашу честь? (у него Ваше имя, фамилия, ник, кличка, и т.д.) - значит, оно. Ну и так далее. То-есть перс одного с вами пола - плохо, если он на вас похож - еще хуже (а самое страшное - если у него внешность "вашей мечты"). А уж если сие в том или ином варианте является вашим альтер-эго/виртуалом, то лучше про написанный текст забыть сразу.
Одно "но": получается, автор обязан писать про свою полную противоположность? А легко ли это сделать?!
Все-таки человек видит мир "своими глазами", с позиции своих жизненных принципов/установок/привычек. И даже когда мы создаем "ниспровергателя устоев", это все равно с тех же самых позиций. Если по жизни я - трезвенник, отличник и пай-мальчик, то сверхсвободный герой у меня бросит учебу, рассорится с родителями, сбежит на Карибы, станет пиратом, и, как полагается пирату, будет пить кружками ром. Потому что для меня эти моменты важны, это противление сложившейся жизни. Тот, для кого поссориться с родителями, неделю ночевать по друзьям, выпить пива в парке - норма, скорее всего, меня не поймет. У него другие рамки, другие точки отсчета.
Не спорю, честь и хвала тем авторам, которые умеют вживаться в любую шкуру и достоверно описывать существо любого характера. Но если подобной уверенности в своих силах нет, почему не сделать главного героя близким к себе, чтобы проще было понять, как и где он поступит?

Еще один нюанс: герой является в некотором роде мечтой автора. Плохо? Но к какому жанру обычно относяся фанфики а так же самостоятельные произведения, где обитают Мэри-Сью? Фэнтези и приключенческие романы. В принципе, большая часть фэнтези тоже является приключениями, только с соответствующим антуражем. А это само по себе есть жанр-мечта. Странствия, сражения, дружба, любовь, коварные враги - тот вечный набор, из которого он строится. (Я ни в коем случае не хочу сказать, что фэнтези и приключения - низкий жанр) И логично, что поселяющийся там герой тоже родом из мечты.
Кстати, почему похожий на автора герой/альтер эго обязательно должен стать манчкином? В конце концов, далеко не каждая автобиография представляет собой энное количество страниц самолюбования.

И наконец, шедевр данного пункта: Вы бы хотели подружиться с данным героем? И прочее, укладывающееся в одну идею: персонаж Вам нравится. А какого это - писать про того, кто тебе неприятен? Что из этого получится? Одно дело - ввести на какую-то второстепенную роль такого субъекта, и другое - сделав его главгероем, описывать его мыли, чувства, переживания. Одно из двух: либо появится симпатия, либо этот фанфик/рассказ станет литературным мазохизмом.

Конец первой части. Про способности и обожание будет дальше, в комментах.